通过肝穿刺去除极少量的肝组织进行病理学检查，是为了确定肝脏病的诊断和病变程度，为制定治疗方案提出依据。对于乙肝患者而言，肝穿刺的目的主要是为了评估慢性肝炎炎症和纤维化的分级、分期，即肝脏炎症及纤维化的程度，以指导乙型肝炎的抗病毒治疗。特别是准备接受干扰素治疗的患者，做肝穿刺意义就更大一些，因为肝脏病变的炎症和纤维化程度与干扰素治疗效果是相关的。

肝脏是一个沉默的器官，当肝脏有轻微的炎症活动时，可以不表现出任何的临床症状，这样就有可能出现临床表现与肝脏病理改变不一致的情况。比如有些病例肝脏炎症潜在发展，持续时间长，虽然没有明显的临床表现，但肝穿刺后的肝脏病理却显示病变较重。这样即可早期诊断早期治疗。一般而言，临床表现重的病例肝脏组织病变也较重；但是，临床表现轻的肝组织病变却未必轻，因此，肝穿刺对判断病情的轻重是很重要的。