目前尚无明确的有效治疗脂肪肝的药物，由于非酒精性脂肪肝常伴有肥胖、糖尿病、高脂血症等，其治疗主要是针对不同的危险因素，如病因治疗（合理控制血糖和血脂等）、饮食控制（低脂饮食、均衡营养等）、运动疗法（有氧运动为主）和药物治疗（降脂药物、护肝药、抗氧化药物）等。其预后主要取决于肝脏的损害程度。仅有脂肪变性通常为一个良性病程，发展成肝硬化者比较罕见。但与普通人群相比，合并糖尿病、体重渐增、老年人和AST/ALT比值> 1的非酒精性脂肪肝患者肝硬化发生率要高。

在治疗中应注意以下几点：① 健康宣传教育，改变生活方式，针对原发病和危险因素分别予以治疗，如减肥、合理控制血糖和血脂、纠正营养失衡等，调整饮食和运动，控制体质量，减少腰围。② 改善胰岛素抵抗，纠正代谢紊乱。③ 减少附加打击以免加重肝脏损害。例如，避免体重急剧下降，避免接触肝毒性物质，严禁过量饮酒。④ 必要时辅助应用保肝药物。⑤ 积极处理肝硬化的并发症，当非酒精性脂肪性肝炎患者合并肝衰竭、失代偿期肝硬化或肝癌时，可考虑肝移植治疗。术前应全面评估危险因素，术后加强代谢综合征的治疗，减少复发，提高患者的生存率。